单细胞数据库汇总AG电子游戏
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scRNASeqDB 是第一个东说念主类单细胞转录组数据库。包含了当今真是扫数可用的东说念主类单细胞转录组数据集（n=38），袒护200个东说念主类细胞系或细胞类型和13440个样本。用户可字据基因或细胞类型搜索基因抒发的信息，同期scRNASeqDB还提供可查询和可视化器用，包括基因、细胞类型或群体间各别抒发基因的谛视信息，另外用户还不错通过Dataset View功能浏览数据库的数据信息。
博彩凭手机靓号彩金网址：https://bioinfo.uth.edu/scrnaseqdb/
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CancerSEA 提供了一个破译癌症单细胞功能情状的数据库，并在单细胞水平上将这些功能情状与卵白编码基因(PCGs)和lncRNA斟酌起来，以促进对癌细胞功能各别的机制性蚁合。包含25种癌症的41900个肿瘤细胞，14种癌症斟酌功能情状，允许用户查询基因(包括PCGs和lncrna)与14种功能情状之间的关系。
网站：http://biocc.hrbmu.edu.cn/CancerSEA/
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Cell Blast 为有用哄骗现存数据进行细胞谛视和跨数据集盘问提供了新的器用和资源，是一个自带高质料参考数据库的scRNA-seq数据检索/谛视器用，能作念细胞类型毅力、发现新细胞类型、谛视一语气细胞情状。
网址：https://cblast.gao-lab.org/
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CellMarkrer 该数据库通过手动集聚卓越100,000篇发表的论文，涵盖细胞标记物信息，组织类型，细胞类型，癌症信息和开始等4,124个要求。
共包含158种东说念主类组织/亚组织（涵盖467种细胞类型，13605个细胞标记物）及81种小鼠组织/亚组织（涵盖389种细胞类型，9148个细胞标记物），旨在为东说念主类和小鼠组织中的多样细胞类型提供全面而准确的细胞标记物质源。
网址：
http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/CellMarker/
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ColorCells 是一个用于相比分析单细胞RNA-Seq数据中lncRNAs抒发、分类和功能的数据库。从6个物种的167913个公开的scRNA-Seq数据集进行分析，发现了一批细胞特异性lncRNAs。盘问单细胞lncRNA的话不错柔软！
网址：https://rna.sysu.edu.cn/colorcells/
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CancerSEA 提供了一个破译癌症单细胞功能情状的数据库，并在单细胞水平上将这些功能情状与卵白编码基因(PCGs)和lncRNA斟酌起来，以促进对癌细胞功能各别的机制性蚁合。包含25种癌症的41900个肿瘤细胞，14种癌症斟酌功能情状，允许用户查询基因(包括PCGs和lncrna)与14种功能情状之间的关系。
网站：http://biocc.hrbmu.edu.cn/CancerSEA/
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CeDR Atlas（细胞药物搪塞数据库）基于文件中东说念主类、小鼠和不同细胞系的特异性药物响应信息，笼统分析了细胞类型特异性药物响应分析，涵盖疾病情状下的细胞类型和以前细胞类型，为细胞药物响应谱提供径直参考。收录卓越582个东说念主类、小鼠和细胞系的单细胞数据终结，包括约140个表型和1250个组织/细胞类型的约188,157个东说念主类斟酌、42660个小鼠斟酌和10299个细胞系斟酌的细胞药物响应信息。
网址：https://ngdc.cncb.ac.cn/cedr
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HCA 东说念主类细胞图谱（Human Cell Atlas）谋略，是当今规模相比大、袒护相比全面的单细胞数据库，尽力于开拓一个健康东说念主体所包含的扫数细胞的参考图谱。主要聚焦于东说念主以前组织，获得东说念主体各个组织器官的单细胞层面数据均可使用这个网站进行下载。不错搜索project的郑重信息、并下载Metadata和Matrices数据自行分析。
网址：https://data.humancellatlas.org/
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HCL(Human Cell Landscape) 是2020年3月25日，由浙江大学基础医学院与浙江大学附庸病院相助完成的东说念主类细胞图谱斟酌盘问恶果于《Nature》在线发表。
数据库包含开始于702,968个单细胞转录组数据毅力的东说念主体102种细胞大类和843种细胞亚类的可视化数据资源，同期scHCL单细胞比对系统可用于东说念主体细胞类型的毅力。
网址：https://db.cngb.org/HCL/
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CDCP（Cell-omics Data Coordinate Platform）是国度基因库人命大数据平台（CNGBdb）上线的一个数据库，格外合适0代码基础小白初学单细胞数据分析。
集成了CNGBdb平台的单细胞数据资源（包括7015个样本和1775570个细胞），为用户提供单细胞数据分析、可视化、下载和递交功能。
网址：https://db.cngb.org/cdcp/
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SCP(Single Cell Portal) 以查询实验遐想和基因在不同cell type中的抒发情况。当今收录419个盘问、卓越1934万细胞的单细胞数据库，况兼抓续更新，数据保重的很好，皇冠娱乐还不错进行浅薄的在线分析。
网址：
https://singlecell.broadinstitute.org/single_cell
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SCPortalen 涵盖了东说念主类和小鼠单细胞转录组学全面的元数据和转录组数据以及细胞图像信息。通过SCPortalen的web界面，用户不错简略地搜索、浏览和下载感景仰的单细胞数据集。
网址：
菠菜网平台app下载http://single-cell.riken.jp/SCPortalen_Database/Home/
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signatureDB 细胞数据库，恶果在2018年发表在新英格兰杂志上，数据以表格的神色进行展示，仅供自行下载盘问。
网址：https://lymphochip.nih.gov/signaturedb/
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SpatialDB 是第一个单细胞空间转录组数据库及数据在线可视化平台，为盘问组织的空间细胞结构提供了一个资源库，并可能为蚁合疾病中的细胞微环境带来新的看法。
收录来自5个物种（东说念主类、小鼠、果蝇、秀雅隐杆线虫和斑马鱼）的24个空间转录组数据集，由8种空间转录组时期（ST、Slide-seq、LCM-seq、seqFISH、MERFISH、Liver single cell zonation、Geo-seq和Tomo-seq）产生的数据，开拓了空间转录组数据分析贬责历程，竣事了空间转录组数据的在线可视化，同期提供了空间各别抒发基因过火功能富集分析的谛视。
网址：https://www.spatialomics.org/SpatialDB/
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KIT（Kidney Interactive Transcriptomics） 是对一些肾脏单细胞著述进行了整理，收录了多样肾脏组织的单细胞数据，构建肾脏单细胞数据集的在线分析数据库。
网址：http://humphreyslab.com/SingleCell/
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BloodSpot 包括了以前东说念主及AML患者、以前鼠的多样血细胞类型的基因抒发。固然只收录了轮回系统的单细胞数据，可是功能弘远，可使用这个数据库进行多种在线分析，况兼不错将分析终结以多样图片的神色导出。
网址：http://servers.binf.ku.dk/bloodspot/
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SC2disease 旨在提供病病例与健康对照之间、病例中不同细胞类型之间以及不同病理进度病例之间基因抒发的各别。用户可探索不同细胞类型、组织和疾病中细胞类型特异性基因的笼统伙源。
网址：http://easybioai.com/sc2disease/
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PanglaoDB 是2019年齿首发布的一个单细胞转录组数据库包含了卓越1000个单细胞实验的预贬责和预测算分析，涵盖了大大齐主要的单细胞平台和分析历程，尽力于探索东说念主类和小鼠的单细胞转录组数据。可用于细胞分群谛视的marker数据库。合适零基础的东说念主使用、探索和挖掘，岂论你是作念东说念主类盘问已经小鼠盘问，齐能用的到。
网址：https://panglaodb.se/index.html
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SCEA(Single Cell Expression Atlas) 是单细胞数据库，收录了多样疾病类型的单细胞数据，包括18个物种、229个study、597万个细胞。不错按gene和experiment检索实验遐想、分析参数、下载marker基因和抒发数据矩阵等。
网址：https://www.ebi.ac.uk/gxa/sc/home
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Tabula Muris 来自小鼠扫数这个词人命周期内20个器官的529823个单细胞的RNA测序数据，使用两种步调分裂出100,000多种细胞类型进行功能谛视。
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为什么系统盘叫c盘网址：https://tabula-muris.ds.czbiohub.org/
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GRNdb（Gene Regulatory Network, GRN）是一个免费拜访和用户友好的数据，旨在便捷搜索和分析转录因子(TFs)和卑鄙靶基因(称为调控子)在多样组织/条件下造成的调控集聚。基于已知的TF-target关系和从内行数据库集聚的大规模单细胞转录组数据，以及TCGA和GTEx数据。适用于多样东说念主类和小鼠条件。
网址：http://www.grndb.com/
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Jingle Bells 免疫一直是科研中经年累稔的话题，不管是在肿瘤规模已经在非肿瘤规模齐有着置锥之地，Jingle Bells等于一个特意存放免疫斟酌的单细胞数据库。
网址：https://jinglebells.bgu.ac.il/
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VascularSingleCell 血管单细胞数据库，收录了东说念主和小鼠的脑血管、肺血管的单细胞数据。
网址：http://betsholtzlab.org/VascularSingleCells/database.html
证券时报记者 张智博
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非小细胞肺癌数据库
该项盘问完成了来自14例非小细胞癌初治患者外周血、癌组织和癌旁组织的12,346个T细胞的单细胞测序责任，形容了非小细胞肺癌的16个T细胞功能亚群、各亚群的组织散布特征及亚群间的情状变嫌关系等免疫特征。
非小细胞肺癌T淋巴细胞图谱：单细胞数据获得历程、T细胞亚群分类、亚群间的情状变嫌关系和变嫌性T细胞的异质性等免疫特征。
网址：http://lung.cancer-pku.cn/index.php
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Tabula Muris 来自小鼠扫数这个词人命周期内20个器官的529823个单细胞的RNA测序数据，使用两种步调分裂出100,000多种细胞类型进行功能谛视：①基于荧光激活细胞分选：袒护度高，可富集特定类型细胞，用于盘问低抒发基因，可变剪接和序列变异分析等；②基于3’终局的微流体液滴计数法：检测的细胞数目多，上风在于好像发现特殊的细胞和细胞情状。
网址：
http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/LnCeCell/
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单细胞测序汇总就到这里了，基本相比全，但愿不错匡助内行盘问前期进行数据探索、更准确地进行细胞谛视和分析。
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